研究人员发现,依靠端粒延长替代机制(ALT)增殖的癌细胞,端粒上竟出现了着丝粒蛋白。这对开发出新的癌症诊断标志物而言具有重要意义。
端粒位于染色体末端,可以保护染色体免于降解或与其他基因组片段异常融合,这类异常融合会加速衰老、诱发癌症。80%~95%的癌细胞依靠端粒酶维持端粒长度,进而实现无限增殖。但有一小部分癌症(主要是软组织癌和骨癌)依靠ALT通路“存活”。ALT通路是癌细胞走投无路时启用的最后求生机制。与利用端粒酶维持端粒长度不同,它是借助DNA修复途径来延长端粒,这就使得此类癌细胞对常规抗癌疗法更具耐受性。
十多年前,美国匹兹堡大学医学中心名为罗德里克 · 奥沙利文(Roderick O’Sullivan)的遗传学家通过蛋白质组学筛查,分析了ALT阳性细胞与表达端粒酶的阳性细胞中端粒的差异。他竟然在ALT端粒中检测到了着丝粒蛋白,这令他震惊不已。着丝粒和端粒无论在位置上还是功能上都相差甚远,因此他将该现象判定为实验误差,遂搁置了这项发现。
然而,几年后,奥沙利文课题组的博士后研究人员拉吉妮 · 巴格瓦(Ragini Bhargava)再次观测到这一反常现象。这促使他们重新审视这一发现并深入探究。在2026年6月发表于《自然》(Nature)的一项新研究中,奥沙利文及其同事发现,着丝粒在ALT癌细胞的端粒上留下了“足迹”;通过这些交互作用形成的独特标记,在维持癌细胞端粒的完整性方面起着重要作用。目前,针对侵袭性极强的ALT肿瘤,临床上尚无有效的诊断方式,而这一基因组特征极具潜力,有望成为新的癌症诊断标志物。
当初奥沙利文认定在端粒中检出着丝粒蛋白是实验假象时,巴格瓦坚持追查。她利用免疫染色技术,在标准的ALT细胞系中发现了端粒和着丝粒相关基序(即α-卫星重复序列)存在异常交互。该基序通常包含着丝粒蛋白A和B(即CENP-A和CENP-B)。巴格瓦还通过DNA测序技术验证了这一发现。奥沙利文补充道:“在每一种被选定的ALT癌细胞系的端粒区域,都明确存在与该基序的关联。”他们在ALT神经母细胞瘤样本中也检测到了相同的基序,证实该现象同样发生在人体实际肿瘤组织内。
奥沙利文与巴格瓦表示,后续将继续深挖关于ALT的研究发现
为进一步解析这一分子特征,研究团队借助长读长测序技术进行了定向甲基化检测,在特定染色体的端粒区域发现了离散排列的CENP-A染色质足迹。他们发现在一些染色体上,这些足迹恰好位于DNA甲基化水平急剧下降的区域。借助该技术,研究人员成功绘制出ALT肿瘤细胞独特的表观遗传变异图谱。
为探明这些着丝粒特征的形成机制,研究团队通过干扰“α地中海贫血伴智力低下综合征X连锁”(ATRX)蛋白的表达来模拟ALT通路的激活过程。ATRX是ALT细胞中最常发生突变的基因。当研究团队将ATRX基因被敲除的ALT阳性细胞与正常非癌细胞进行比较时,他们发现ATRX基因缺失与DNA低甲基化会促进这些着丝粒染色质特征的形成。同时,限制CENP-A的积累会影响端粒完整性,这就凸显了着丝粒蛋白在维持ALT癌细胞增殖中的关键作用。总体而言,这些发现为端粒与着丝粒之间的交互作用提供了证据,并且表明这些“足迹”在ALT肿瘤中发挥着重要功能。
巴格瓦表示:“这项研究可谓结合了天时和地利。如果我们在5年前开展同样的研究,结果会大不一样。”她补充称,测序技术和端粒到端粒组装技术的突破,为该研究的相关分析提供了巨大助力。
悉尼大学及澳大利亚儿童医学研究所的遗传学家希尔达 · 皮克特(Hilda Pickett)专注于研究端粒维持机制,长期以来对ALT抱有浓厚兴趣。她本人并未参与这项新研究,却对研究成果给予高度评价:“这篇论文非常精彩!其优势在于,研究团队运用了多种前沿基因组技术,同时构建了多套细胞模型。我很惊讶我们之前竟然没有真正注意到或认识到这一点。”
谈及该成果在领域内的影响,皮克特提出多个感兴趣的方向:这类分子足迹的分布范围是怎样的?为何它们会定位于特定端粒区域?该现象是否在其他癌症中同样存在?能否依托该发现开发出新的疗法?她指出:“这是一个极具潜力的研究体系。”
奥沙利文与巴格瓦也持相同观点。尽管癌细胞非常狡黠且适应力强,但研究团队仍然希望通过后续研究找到新的治疗靶点。
资料来源 The Scientist

