我和我的基因组

发布时间：08年10月01日

编译傅佑丽

用一种个性化的DNA读写方法来看一眼自己的基因,将会是怎样的感受? 5位在不同领域工作的人士用上述方法看到了自己基因, 并从各自的角度谈了测序后的感想——

　　2002年,在耗资30亿美元的人类基因组计划(HGP)完成之前,一些生物学家就开始谈论一个话题:仅仅花费1000美元,就能对任何个体的完整基因组进行测序。然而随着DNA测序日益廉价和快速,迄今我们还没有达到预定目标:用目前的方法,人类基因组中仍有大约十分之一的基因无法测序。

　　但是,个人基因组时代似乎已经悄悄地来到我们身边。目前,有3家公司直接向公众提供范围较广的DNA读出服务。最早提供服务的是去年11月份成立的、由Googl e提供资助的“23andM e”公司,紧接着是冰岛的“deCodeM e”公司,这两家公司均开出大约1000美元的价格。今年4月,总部设在硅谷的“Navi geni cs”公司推出了一个服务套餐,价格是2500美元加250美元的年费。这样你就有了“遗传顾问”了,并且该公司还将冷冻保存你的DNA,便于随着测序技术的进步对DNA进行再分析。

　　既然仍有约十分之一的基因组无法测序,那么是否值得拥有一份自己的基因组测序结果呢?这些结果会改变人生吗?是匆匆而过的一点乐趣,还是通向更健康、更幸福人生之路的第一步?为了回答这些疑问,《新科学家》杂志访谈了5位已经做过个体基因组扫描的人士。

　　“如果你的医生知道你一个月后将离开人世,你希望被告知实情吗?”

特里·德罗特斯 (Terry Drotos),53 岁,IT分析师和技术指导,加州雷德伍德市

　　我想做基因组扫描,主要是因为我被测试公司接受了。我一直很担心,不要从我这里开始给我的女儿任何疾病家族史,于是我参加了“Navigenics”公司的β测试小组。

　　就我的基因组扫描结果而言,没有什么真正可怕的东西,这是个好消息。我患老年痴呆症的可能性低于平均水平,对此我真是太感激了!我的养母今年92岁,现处于老年痴呆症的晚期,看着发生在她身上的事,真是太可怕了。

　　有趣的是,我的确有一个较高的患病风险,有高于平均水平的患Ⅱ型糖尿病、肥胖和骨关节炎的风险。它使我真正认识到如果过去我不运动、不注意饮食、没有好好照顾自己,那么这时我可能会遇到一些健康问题。

　　另一件十分有趣的事是,在我参加测试期间,我的女儿开始减肥并注意降血压。那段时间我对基因组扫描一直缄口不言,因为我不想小题大做。但是当她看到扫描结果时说:“噢,天啊。”我不能告诉你她是如何完全转变的。从圣诞节至今,她体重减了大约20磅。正是基因组扫描激励了她。对我而言,这是最好的结果。

　　无疑,“Navigenics”公司给我的全部建议就是合理饮食、运动和戒烟,但这仅仅是开始。它还将更多地针对一个人的遗传组成,来设计适当的药物治疗。以我的养母为例,她一直在服用治疗老年痴呆症的不同药物,有些药物使她十分痛苦。如果像这样的遗传测试能够查明,她身体里缺乏使一种药物发挥/不发挥作用的某种酶,那将为她免除很多病痛。

　　如果你的医生知道你一个月后将离开人世,你想让他告诉你实情与否?我当然想让他以实相告。我要做自己的主人。一味只是被接受和从来不能发现什么,一直被我视为是很丢脸的。我现在觉得拥有了一些东西———没有人能够从我这里拿走的东西。

　　“我告诉了父母我正在做基因组扫描,他们不准我告诉他们任何东西”

马克·弗莱彻 (Mark Fletcher), 37 岁, 网络公司业主, 加州雷德伍德市

　　我想要做基因组扫描,是为了了解我患老年痴呆症的可能性,因为我的祖父母中有2位患有此病。

　　我告诉了父母我正在做基因组扫描,他们不准我告诉他们我发现的关于老年痴呆症的任何东西。对他们的这一反应我感到有点惊讶,不过目前我还没有陷入到他们面临的困境中。如果老年痴呆症的症状要表现出来,父母显然离它更近。

　　当时,“23andMe”公司正在为20名或不同条件和特征的人士提供检测报告。我觉得扫描结果很有趣,但是它也有点令人失望,因为它不是非常有用。例如,我患Ⅱ型糖尿病的风险稍高,患Ⅰ型糖尿病的风险稍低。不过,这些只是与平均水平相比非常小的偏差。这个结果没给我留下深刻印象。

　　于是,我进入了原始的SNP数据库,在那里我希望找到更多关于我患老年痴呆症的风险的东西,因为“23andMe”公司没有对此提供一份完整的报告。原始数据是该项服务的核心,但是它们并没有给你解释老年痴呆症的任何额外信息。我开始在互联网上到处寻找,无意中发现了一个资源库SNPedia,它基本上是SNPs的百科全书以及SNPs与患病可能性的联系。

　　对照SNPedia,我发现了原始数据中少量的与老年痴呆症有关的SNPs。但是,有最紧密联系的SNP并不在“23andMe”公司列出的基因型对应的60万个SNPs中。我能够查阅到的SNPs显示,我不易患早发性老年痴呆症(early-onset Alzheimer’s disease)。这很好,但可以预料出,因为我的亲属中都没有这种病。

　　总的来说,我有点失望,但我认为也要现实一点。我隐隐觉得这门科学目前还是非常初级的。即使事先知道了现在我已经知道的这些东西,我仍旧要做基因组扫描,因为我喜欢它的科学的方面。当对人的完整基因组的测序费用不太昂贵时,我还将做完整的测序。

　　“易感性基因仅仅给了部分甚至可能是误导性的信息”

罗伯特·格林(Robert Green), 53 岁, 医学研究人员, 马萨诸塞州波士顿

　　我给“Navigenics”公司和“23andMe”公司无偿提供了一些非正式的建议。“Navigenics”公司邀请我做β-测试,“23andMe”公司则给我提供了免费的测试。当看到测试结果时我十分好奇,但是我也好奇地发现这两家公司的测试结果并不相同。

　　“Navigenics”公司要求你“选择进入”每一种情况,这点考虑得不错(如果你只想知道一种情况而不想知道另一种)。我看了老年痴呆症的相关检测数据,并且我知道它是一个反映ApoE基因的SNP,我便着手检查了它。那一时刻真是有趣,因为我一直在波士顿大学研究ApoE基因和老年痴呆症,差不多有10年了。我曾有很多次机会来做自己的基因组检测,但从来没有做过。我想原因是,如果结果是阳性的,我不想面对它。根据“Navigenics”公司的结果,我发展成老年痴呆症的风险较平均水平低。这对我真是个解脱。

　　我迫切想弄明白的另一件事情是关于心脏基因的报告。我52岁时患了冠心病并做了三支冠状动脉分流术(triple bypass)。这是不寻常的,因为我不抽烟,不超重,参加运动且胆固醇也是正常的———这意味着我的冠心病是遗传性的。但是,这2家公司的检测结果均显示,我患心脏病的风险与平均水平并没有明显不同。

　　我的一些其他的检测结果也说明了目前这项服务存在的问题。例如,在“Navigenics”公司的报告中,我的多发性硬化(multiple sclerosis,神经系统的一种疾病)一栏被强调成橙色,这意味着我患此病的风险高出平均水平20%多。但是,患此病的平均风险值是0.3%,那么我的风险值也就是0.5%。那是非常非常低的风险,然而这一栏仍是橙色,这是设计程序的算法造成的。

　　我赞成一些评论家说的话,即对一个个体而言,报告的适度效应值是很难得到有意义的解释。患Ⅱ型糖尿病的平均风险是25%,我的是19%。我知道,我的疾病家族史在决定患病风险上要远比这些易感性基因重要。因此,它们只是给了部分甚至可能是误导性的信息。

　　这两家公司均非常周到地解释说,你必须要把结果放在整个基因组中考虑,除遗传学外,你的患病风险还取决于别的因素。可问题是,只是通过浏览一下检测结果,人们如何知道需要阅读检测报告中的多少内容?他们又能弄懂多少?

　　我认为,我们真的要把这种个人基因组学与有问题的基因组学(人们正在基于这种有问题的遗传学进行营养搭配和缔结姻缘)严格区别开。这二者是非常不同的。我们都能争论“Navigenics”公司和“23andMe”公司给出的信息数据,但是他们一直在正当地做着基因组扫描,并尝试着公平地解释获得的数据。他们负责并努力做到这点,我认为是非常好的。

　　最终,我准备半信半疑地接受我的测试结果。这门学科目前仍不很精确。但是,当我们得到更多的、可以真正确定患某种特定疾病的风险的基因时,目前的这些伙计们在提供基因组信息方面将是领先的。他们从事的工作是尖端科技。

　　“我患病风险最高的是不宁腿综合征,我认为是个玩笑!”

佩里·皮克尔特 (Perry Pickert), 32 岁, 视频制作人, 旧金山

　　我参加了“Navigenics”公司的β-测试小组,因为我有个中学同学在这家公司工作,因而我也得到了免费服务。但是不管怎样,对我来讲它值2500美元。这并不是说我那周就将做这个测试,但最终肯定会做的。

　　我的结果都非常好。我的祖父死于前列腺癌,父亲患有结肠癌,因此我想我患这两种病的可能性将很高。但是,我患这两种病的可能性比平均水平低大约30%,真令我欣喜若狂!到目前为止,我患病风险最高的是不宁腿综合征(restless legs syndrome,不宁腿综合征是一种运动性睡眠疾病,主要特征是在静息状态下出现难以名状的腿部不适感,而迫使肢体发生不自主的运动———译者注)。我以前从没听说过此病。起初我认为是我的一个朋友给我开玩笑,虚构了一个不存在的疾病。另外,我还有患黄斑退化(Macular degeneration,是一种无法治疗的眼疾,全球约有2500万人患有此病,它通常发生于老年人,会有视力模糊、视野有阴影或视野中央歪斜扭曲的情形———译者注)的较高风险,这有点让我不放心,于是买了一副墨镜。

　　过去对我来说最大的问题是安排一种合理的方式来管理自己的健康。我没有健康计划,也没有家庭医生,只是在患了严重疾病时才去医院就诊。我厌恶去医院,那地方非常缺乏人性化。每次我走进医院那扇大门,都以这种方式结束:付了不少钱,但是没有得到任何有用的东西。医生看病的时间大约只有6分钟,我必须要理解他们说的每句话,然后快速地提出问题,这样才能得到我需要的信息。我总感到很沮丧,什么也没弄明白。我真的有几次很让人讨厌的就医经历。

　　例如,大学最后一年里,我不慎受伤了。医生说,他们确定我的前十字韧带(anterior cruciate ligament)撕裂,需要做手术,需要一年的恢复时间。我当时吓坏了。从医生那里出来,我在网上查询了一下。经过网上的仔细研究,我认识到他们使用的诊断方法并不是非常准确。我对医生说:“你们开始手术前,务必给我看看撕裂的前十字韧带”。经再次诊断,医生确定是半月板(meniscus)撕裂,而这是不太严重的受伤。

　　我曾有过一次愉快的就医经历,在我看来那是因为我知道正在谈论的内容。我按照预约准时前来,而不是完全无助的那种,那就是现在称为良好的医患关系吧。医生和患者都拥有信息,来共同对付疾病。

　　那就是我对“Navigenics”公司提供的信息充满期望的地方。我认为,它给了我一个平台,当进入其中时,我感到能弄懂很多东西。这就像你初到意大利时,事先你已上了至少一节意大利语课。因此,你知道如何说“你好,请问浴室在哪里?”然后,就比较容易地学会并把所有其他的信息融入整个环境中。对我而言,它是完美的。

　　“我全家都决定做它,因此我们能互相比较染色体”