亚当·苏梅尔斯将其喜欢扫描动物的业余爱好发展成了一项工作,他探索发现的工作方法简单高效,启发了同行,同时也吸引了一批志同道合的科研人员从事该项研究工作。因其研究工作为解剖学、进化学等领域工作开拓了新视角,其领衔的研究工作获得美国国家科学基金会(NSF)资助。
计算机断层扫描图像(从左至右):水虎鱼(梅氏锯脂鲤),念珠蜥蜴和北极露脊鲸
亚当·苏梅尔斯(Adam Summers)喜欢给死鱼进行计算机断层扫描,也就是常说的CT,他甚至已经把这个特殊的爱好发展到了学术痴迷的程度,因此获得了“鱼人”的绰号。他是个生物力学家,实验室在美国华盛顿圣胡安岛上的星期五港口。他说,“刚开始那会,我都会用士力架来换CT扫描的机会。”20年来,他一直扫描保存在液体中的鱼类标本,得到精细的3D图像,研究错综复杂的动物内部结构。每当他在网上发布这些精美的骨架图时,粉丝们就会急切地追问下一次会扫描什么鱼。苏梅尔斯总是半开玩笑地回应:“别着急,一个一个来,我会把所有的鱼类都扫描了。”
去年,美国佛罗里达州自然历史博物馆的爬虫学家大卫·布莱克本(David Blackburn)在“推特”上看到了苏梅尔斯发起的话题――扫描所有鱼,突发奇想,他说:“我将扫描所有青蛙。”布莱克本刚与博物馆馆长交流完其想法后,就给苏梅尔斯打了电话。他们决定寻找资金,增加投入,来实现“扫描一切”的目标。现在他们已经获得美国国家科学基金会250万美元的资助,2017年9月1日已经开始该项目――3D图像中脊椎动物多样性的开放性研究(简称oVert)。在接下来的4年中,布莱克本负责的工作是:用CT扫描2万多个来自全美国16个博物馆和大学的脊椎动物标本,覆盖已知种属的80%。oVert将从其中选择约1 000个样本(代表了大部分脊椎动物家族)用碘染料浸泡,从而加深软组织中的对比度,以便科学家们看到肌肉、循环系统、脑组织等。
项目得到的3D透视图将被上传到由杜克大学的进化人类学家道格·博耶尔(Doug Boyer)创办的MorphoSource的数字文献库里,这些数据将对几个研究领域的学者免费开放,包括比较解剖学、进化学、发育生物学和仿生学。布莱克本表示,“目标是让标本离开陈列架,更多地进入研究人员的手中,用到大规模的研究课题中。”
“很快,研究人员就能轻松获得所有脊椎动物的多样性结果,该项目将立即产生效用。”美国布朗大学的脊椎动物形态学者贝思·布雷纳德(Beth Brainerd)表示。
苏梅尔斯的业余爱好变成正式工作是从2015年他的实验室终于拥有CT扫描仪开始的。他偶然发现了一种提高扫描效率的简单方法:用酒精浸透的粗棉布把鱼独立包装,能防止干燥,裹叠成他所谓的“鱼卷饼”,这样能够一次扫描多个标本。迄今为止,他已经完成了2400个不同种类、涉及4500多个标本。
很多其他研究人员从苏梅尔斯实验室的鱼类CT扫描结果中获益匪浅。美国塔夫茨大学的卡珊德拉·多纳泰利(Cassandra Donatelli)想设计一种用于水下勘探的节能机器人,她使用3D模型模拟细长鱼类的关节和运动。德国波恩大学神经解剖学家迈克尔·霍夫曼(Michael Hofmann)正在开展对鱼类内耳的比较研究,希望弄清它们的听觉和定位。2017年4月,oVert项目的参与者之一,德州农工大学的鱼类馆长凯文·康威(Kevin Conway)展示了一种新的喉盘鱼,在扫描照片中,那种鱼的嘴里长着约2000颗微小的牙齿,就像牙刷上的刷毛。
苏梅尔斯实验室的博士后研究人员马修·科尔曼(Matthew Kolmann)说,“让我吃惊的是,几乎每扫描一个种类,我们都会有新的发现。”水虎鱼的CT扫描结果显示,这种鱼会相互在对方骨头上留下细细的咬痕。布莱克本称这种发现是“自然历史附产物”,偶然揭示了动物的生活方式。
在研究一些只有一两件标本的罕见生物体的解剖学特点时,扫描是一种尤其有效的工具,布莱克本补充说,“因为没有人会想到真的解剖这些生物体标本。”(扫描结果还能揭示出一些生物的饮食情况,布莱克本发现青蛙的胃里有蚂蚁、螃蟹甚至还有其他的青蛙。)
在oVert项目中,6所已经拥有扫描仪的大学将扫描机构拥有的标本以及来自另外10个机构的标本。4位研究人员负责寻找适当的鸟类和哺乳动物标本,不过这是很有挑战性的工作,因为这些动物大都被干燥后制成了陈列标本。oVert旨在找到内脏完整的液体保存标本,这种标本仅在爬行动物、两栖动物和鱼类中比较常见。
注射了碘染料的青蛙显露出肌肉、腺体、神经系统、卵、寄生虫等
康威将负责扫描体型巨大的标本,预计是500个,长度可达2米,体重可达250千克。另外,超大的物种将会使用幼体或胎儿标本。从前,他的团队扫描过雀鳝、鳗鱼、北极露脊鲸胎儿,甚至一条2.5米长的大眼沙龟鲨。
这些标本多由博物馆收藏,虽然年代久远,外表可能残破,但是内部构造应该还是保存完好的。同时再用碘染料加深标本内部的对比度。项目的神经解剖学顾问、北卡罗来纳州大学的卡拉·郁帕克(Kara Yopak)预言,除了其他用途之外,oVert将开启稀有物种脑部进化研究。
促进教育和扩大研究是oVert的主要目标。佛罗里达自然历史博物馆的脊椎动物古生物学馆长布鲁斯·麦克法登(Bruce McFadden)喜欢在K-12教育中使用3D模型。以前,他与科学和艺术领域的教师们合作,根据牙齿CT扫描结果,帮助一群中学生重建与原物一般大小的史前鲨鱼下颚。
科学家将能够探索数千种物种的脊椎形状和解剖学,博耶尔很兴奋,他说:“先将以往我们认为正确的解剖学上的进化知识都放到一边,这次研究的范围与以往有很大的不同,我们必须用全新的眼光看待。”
资料来源 Science
责任编辑 游 溪